提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
中国LPR连续8个月“按兵不动” 房贷环境底部平稳******
中新社北京12月21日电 (记者 庞无忌)中国贷款市场报价利率(LPR)已连续8个月未做调整。
21日,中国人民银行授权全国银行间同业拆借中心公布最新一期贷款市场报价利率。数据显示,1年期LPR为3.85%,5年期以上LPR为4.65%,LPR已连续8月“按兵不动”。
贝壳研究院首席市场分析师许小乐表示,随着中国经济持续修复,货币政策回归常态,购房信贷环境延续底部平稳状态。
据贝壳研究院数据,12月份,中国36城主流房贷利率继续保持不变,首套利率5.22%,二套利率5.51%,至此已连续5个月保持在这一水平。36城房贷平均放款周期继续保持延长态势,12月为48天,环比延长2天,是下半年以来最高水平。四季度以来银行房贷放款节奏持续放缓。
近期召开的中央经济工作会议指出,明年宏观政策要保持连续性、稳定性、可持续性。要继续实施积极的财政政策和稳健的货币政策,保持对经济恢复的必要支持力度。许小乐说,稳健的货币政策要灵活精准、合理适度。同时,房地产降杠杆继续深化,购房信贷环境将会保持稳定。
易居研究院智库中心研究总监严跃进指出,根据后续货币政策等情况预测,LPR下调空间不大。是否上调,要看后续经济环境变化。目前,国际市场利率环境比较宽松,预计低利率的水平会持续。总体上看,中国利率水平大概率保持稳定。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎)